Con el paso del tiempo se fueron introduciendo cambios en el cómic original para hacerlo más atractivo para los jóvenes. A pesar de que el proyecto original de Lee y Kirby había sobrevivido hasta los 70, se hacía necesaria una transformación. Por esa razón, se contrató a nuevos guionistas y dibujantes, se incluyeron nuevos personajes y se crearon series de cómics que se centraban en las distintas coaliciones de mutantes.
El cómic sigue editándose en la actualidad con mucho éxito, a pesar de que a principios de los 90 tuvo una pequeña crisis creativa. El abandono de Chris Claremont, uno de los principales guonistas en la historia de los mutantes, supuso un grave vacío creativo que no se solucionó hasta el regreso del guionista. El estreno de la trilogía de películas basadas en la obra de Lee y Kirby han revitalizado muchísimo al cómic, que ha vuelto a ser uno de los más vendidos de la Marvel.
El cómic ha seguido con su evolución y han ido apareciendo nuevas sagas y aventuras de personajes. La última de estas series ha sido "New X-MEN: Academy X", que narra las peripecias y los desafíos a los que deben hacer frente los nuevos alumnos del Profesor Xavier.